Trước năm 1975, Phú Khương là một ấp thuộc xã An Hội, quận Trúc Giang, tỉnh Kiến Hòa. Sau năm 1975, ấp Phú Khương được chuyển thành xã Phú Khương thuộc thị xã Bến Tre.

Ngày 25 tháng 6 năm 1999, Chính phủ ban hành Nghị định 41/1999/NĐ-CP[1]. Theo đó, thành lập phường Phú Khương trên cơ sở toàn bộ 597 ha diện tích tự nhiên và 15.414 người của xã Phú Khương.

Ngày 9 tháng 2 năm 2009, Chính phủ ban hành Nghị định 08/NĐ-CP[3]. Theo đó:

• Điều chỉnh 295,53 ha diện tích tự nhiên và 4.664 người của phường Phú Khương để thành lập phường Phú Tân
• Điều chỉnh 81,69 ha diện tích tự nhiên và 1.289 người của xã Phú Hưng về phường Phú Khương quản lý.

Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính, phường Phú Khương có 365,91 ha diện tích tự nhiên và 11.602 người.